Полноценная зоологическая экспозиция в музее создана благодаря многолетней работе В.Н. Сотникова.
Вся коллекция собрана на основе многочисленных экспедиций в Среднюю Азию (Туркменистан, Таджикистан, Казахстан), на Дальний восток (Камчатка, Командорские острова, Южное Приморье) и Сибирь (Уральские горы, Республика Тува).
Также в коллекции музея представлены экспонаты переданные частными коллекционерами и научными учреждениями зоологического профиля (Зоологический музей МГУ, МГПИ, Дальневосточный ГУ в городе Владивостоке и др.).
Благодаря обменам в коллекции имеются птицы из Северной Америки (США), Южной Америки (Перу), Африки, Турции, Индии, Вьетнама, Монголии, а также тропические пресмыкающиеся (хамелеоны, ящерицы).